神測協の組織は下記の組織図の通りになっています。
総会は正会員及び特別会員をもって構成し、協会の運営に関し重要な事項を議決します。理事会は総会の議決した事項の執行に関することや、総会に付議 すべき事項、総会の議決を要しない会務の執行に関する事項などを審議します。理事会の下には常設委員会として総務広報委員会、経営委員会、技術委員会があ り、それぞれ所管事業を実施しています。このほか、神測協の下部組織として川崎支部・横浜支部・神奈川支部の3支部があり、それぞれの地域に関する独自の活動も行っています。
